Сформирована 1 августа 1941 г. (приказ Закавказского ВО от 23 июля 1941 г.) в Закавказском военном округе на базе 40-го стрелкового корпуса для прикрытия государственной границы СССР с Ираном. В нее вошли 20-я, 77-я горнострелковые, 17-я кавалерийская дивизии и ряд отдельных частей.
С 23 августа 1941 г. включена в состав Закавказского фронта.
В октябре 1941 г. перегруппирована на Северный Кавказ, в район Махачкалы, в конце ноября — на Черноморское побережье в район Анапы. В Керченско-Феодосийской десантной операции 1941-1942 гг. ее войска во взаимодействии с 51-й армией и силами Черноморского флота освободили Керченский полуостров, овладели городом и портом Феодосия (29 декабря 1941 г.). 30 декабря армия вошла в состав Кавказского фронта.
28 января 1942 г. передана Крымскому фронту, в составе которого зимой и весной вела боевые действия за удержание Керченского полуострова.
С 8 мая во взаимодействии с другими армиями и силами Черноморского флота отражала наступление превосходящих сил противника и после тяжелых оборонительных боев была вынуждена отойти к г. Керчь, а затем эвакуироваться на Таманский полуостров.
С 20 мая 1942 г. ее полевое управление с армейскими частями было включено в состав Северо-Кавказского фронта и сосредоточено сначала в г. Тихорецк, а затем — в г. Махачкала. Директивой Ставки ВГК № 170422 от 29 мая 1942 г. управлние армии решено было не восстанавливать.
16 июня 1942 г. армия в составе 138-й, 156-й, 157-й, 236-й, 302-й стрелковых дивизий и ряда отдельных частей передана Закавказскому фронту II формирования и до августа оборудовала оборонительный рубеж от устья р. Терек до Гудермеса. С 9 августа входила в Северную группу войск фронта и в ее составе осенью 1942 г. вела упорные оборонительные бои, прочно удерживая занимаемый рубеж. В декабре нанесла ряд контрударов и отбросила немецкие войска в район севернее г. Моздок.
В январе 1943 г. наступала на ставропольском направлении, 21 января освободила г. Ворошиловск (Ставрополь). 24 января включена в Северо-Кавказский фронт II формирования, с 6 февраля переподчинена Южному (с 20 октября 1943 г. 4-й Украинский) фронту II формирования.
На заключительном этапе Ростовской операции войска армии освободили г. Азов (7 февраля) и к 18 февраля вышли на рубеж Рясный, левый берег р. Самбек (восточнее и северо-восточнее Таганрога), который прочно удерживали до начала за освобождения Донбасса.
В ходе Донбасской стратегической операции 44-я армия во взаимодействии с 28-й армией силами кавалерийских и механизированных соединений фронта нанесла поражение таганрогской группировке противника и во взаимодействии с десантами, высаженными Азовской военной флотилией, и партизанами освободила Таганрог (30 августа).
В ходе последующего успешного наступления во взаимодействии с силами Черноморского флота освободила 10 сентября Мариуполь. С 26 сентября принимала участие в Мелитопольской операции.
8 конце октября была выведена в резерв фронта, перегруппирована в район северо-восточнее Каховки и, сменив части 5-й ударной армии, обороняла рубеж Завадовка, Каховка, Британы.
9 ноября 1943 г. полевое управление 44-й армии было расформировано, а ее войска переданы в состав других армий. |